Výskumná infraštruktúra

Morfologická, histochemická, subcelulárna a imunocytochemická analýza

· Elektrónový mikroskop TESLA BS 500 (zobrazenie povrchovej a vnútornej štruktúry vzorky)

· Konfokálny mikroskop NIKON ECLIPSE Ti-E (A1R+) (zobrazenie a vyhodnotenie fluorescenčne značených preparátov vzoriek; Fluorecenčný mikroskop (zariadenie na detekciu a archivovanie fluorescených signálov vzorky)

· Svetelný mikroskop (Zariadenie na skríning celulárnych kultúr v svetlom poli)

Zariadenia na prípravu vzorky

· Ultramikrotóm Leica EM UC7 (príprava polohrubých a ultratenkých rezov z biologických vzoriek zaliatych v médiu)

· Kryostat Leica CM1950 (príprava polohrubých a ultratenkých rezov zo zmrazených biologických vzoriek pri nízkych teplotách )

· Bunkový izolátor GentleMACSTM Octo Dissociator (zariadenie na disociáciu a homogenizáciu vzorky)

· Lyofilizátor Scanvac Cool Safe 55-4 (Zariadenie na dehydratáciu vzorky)

Zariadenie pre Biochemické a molekulárne analýzy

· Mikrolitrový spektrofotometer NanoVue™ Plus Spectrophotometer (Zariadenie na kvantifikáciu nukleových kyselín a proteínových vzoriek)

· Thermocycler: CFX96 Touch™ Real-Time PCR Detection System (Zariadenie pre kvantitatívnu amplifikáciu templátu v reálnom čase)

· Ultracentrifúga Optima™ XPN -100 (Separácia jednotlivých elementov vo vzorke pri ultravysokých otáčkach)

· Centrifugačný koncentrátor CentriVap (Zariadenie na zakoncentrovanie vzorky)

· Multiphor II Electrophoresis System (Systém na charakterizáciu proteómov pri variabilných podmienkach)

· Vertikálne elektroforetické a blotovacie zariadenie Biorad Mini-PROTEAN (Zariadenie je určené na elektroforézu a tranfer proteínov z gélu na membránu)

Zariadenie na výskum bunkových kultúr

· CO2 inkubátor pre bunkové kultúry ESCO (Inkubačná stanica s kontrolovanou atmosférou)

· Biohazard box Bio II Advance 4 (Pracovný box s filtrovanou atmosférou)

· Prietokový cytometer Guava easyCyte 8HT (Zariadenie určené na charakterizáciu bunky na úrovni jednej častice)

Zariadenia pre kvapalinovú chromatografiu a hmotnostnú spektrometriu

· Chromatograf: Ultimate 3000 RSLC nano (Zariadenie nanoobjemovej chromatografie); Hmotnostný spektrometer: Amazon SL

Zariadenia pre fluorescenčnú spektroskopiu a luminiscenciu

· Modulárny spektrofluorometer FluoroLog (Fotoluminscenčné detekčné zariadenie určené na detekciu fyzikálnych charakteristík a parametrov analyzovaných vzoriek)

· Multidetekční reader Synergy H1  (Hybridný systém určený na detekciu a analýzu luminiscencie a fluorescencie

Zobrazovacie systémy

· Amersham Imager 600 (Zariadenie na zobrazovanie chemiluminiscenčných, fuorescenčních a kolorimetrických vzoriek)

· Typhoon FLA 9500 (Laserový skener umožňujúci zobrazenie a kvantifikáciu proteínov, nukleových kyselín a iných biomolekúl)

Zariadenia na fyziologické experimenty

· Pneumotachografický merací systém, Ad Instruments (Prístroj určený na zaznamenanie krvného tlaku a srdcovej frekvencie pre malé zvieratá)

· Langendorffova aparatúra (Systém je zariadenie určené pre „in vitro“ experimenty); (Kompletný systém na experimenty in vivo vrátane chirurgických zákrokov na koronárnych artériách)

· Kardiovaskulární ultrazvukový systém Vivid E9 XDclear (Elektrokardiografické a ultrazvukové zariadenie pre malé zvieratá)

· Hypoxická komora: COY model 30 (Hypoxická komora pre in vivo štúdie)

· Analyzátor krvných plynov: ABL80 FLEX (Prístroj určený  na stanovenie základných parametrov krvných plynov a elektrolytov)

· Zobrazovací systém: KODAK In-Vivo Imaging System FX Pro (Systém na sledovanie distribúcie a lokalizácie látok v  "in vivo" experimentoch určený pre malé pokusné zvieratá

Systém na úpravu vody

· Direct-Q5 (Systém na úpravu vody)


Morfologická, histochemická, subcelulárna a imunocytochemická analýza

Elektrónový mikroskop TESLA BS 500 (zobrazenie povrchovej a vnútornej štruktúry vzorky)

 

  • Mikroskop je konštruovaný na princípe prežarovania – elektróny vyletujú z katódy, sú urýchľované vysokým napätím, prechádzajú dvoma kondenzormi, preparátom a zobrazovacou sústavou tvorenou objektívom, pomocným projektívom a hlavným projektívom. Po dopade na fluorescenčné tienitko sa vytvára viditeľný obraz.
  • Optickú sústavu mikroskopu tvorí osvetľovacia sústava, ktorá sa skladá z:
  • elektrónovej trysky, zloženej z katódy, Wehneltovho valca a anódy, spolu tvoria elektrostatickú šošovku. Medzi katódou a anódou je vysoké napätie, urýchľujúce elektróny, emitované z wolfrámovej katódy.
  • dva kondenzory
  • zobrazovacia sústava.
  • Mikroskop ďalej tvoria:
  • Podstavec tubusu, ktorý nesie tubus a vákuovú jednotku (2 vývevy – rotačná a difúzna).
  • Tubus obsahuje projektory (projekčná sústava), magnetický objektív, komory preparátu, clonu a uzávery, kondenzory s elektromagnetickými cievkami a anódu.
  • Krídla stolu obsahujúce elektroniku mikroskopu vzájomne spojené s nosníkom za podstavcom tubusu. Rámy krídel sú oceľové.
  • Všetky elektrické jednotky sú prepojené 2 kábelovými jednotkami. Kábelové formy sú upevnené oceľovými páskami/príchytkami. Elektrické obvody sú rozlíšiteľné farebne.

Konfokálny mikroskop NIKON ECLIPSE Ti-E (A1R+) (zobrazenie a vyhodnotenie fluorescenčne značených preparátov vzoriek)

 

Ako zdroj svetla je použitý laser, čo zabezpečuje ostrosť a kontrast obrazu s vysokým rozlíšením. Základným princípom je, že sa obraz nevytvorí naraz v celku, ale bod po bode riadkovaním. Pomocou riadkovania sú snímané optické body v rovine XYZ, čím je zabezpečené zobrazenie trojrozmerných objektov.

Zariadenie umožňuje:

obrazovú analýzu, sledovanie objektu v čase, analýzu obrazov v posune na osi Z, rozšírené zaostrovanie, automatické zaostrovanie, 3 zobrazovanie, heterogénne snímanie, mozaikové modulovanie, ovládanie cez internet

Zariadenie disponuje (má):

  • 6 optických výstupov: okulár 100%, ľavý 100%, pravý 100%, okulár 20%/ľavý 80%, dva ďalšie pre voliteľné zariadenia
  • motorizovaný objektívový revolver pre 6 objektívov so systémom automatického
  • motorizovaný karusel pre 6 fluorescenčných filtrov
  • motorizovaný PIEZO Z stolček (ultra rýchly stolček) Piezo Z-stolček (ultra rýchly Z-stolček ); rozsah posunu (Z): 100 µm; veľkosť kroku: 0.2 nm; rezonančná frekvencia: 600 Hz ± 20%, s násadcami pre podložné sklíčka a Petriho misky a XY TI-S-ER motorizovaný stolček s kódovaním; krížny posun: 110 X x 75 Y mm; krok: 0.1 µm; opakovateľnosť: 0.5 µm
  • motorizovaný otočný kondenzor
  • informačný panel o svojich nastaveniach (zväčšenie, Epi filter a pod) a k tomu externý ovládací  panel s displejom s ovládaním
  • zabudované optické medzi zväčšenie 1.5x
  • bezpečnostnú uzávierku proti úniku laseru do okulárov
  • zorné pole okulárov 22mm a kondenzor pre predpísané metodiky
  • okulár so zväčšením 10x
  • optiku zloženia: 10x typu PLAN APOCHROMAT s N.A. 0.45, 20x typu Plan Fluor s N.A. 0.75, 40x typu Plan Apochromat a na immerziu (vodná / olejová) a s N.A. 1.25 voda, N.A. 1.3 olej, 60x typu Plan Achromat na immerziu vysokej svetelnosti a s N.A. 1.27 voda, N.A. 1.4 olej
  • fluorescenčné zariadenie s externým zdrojom širokospektrálneho osvetlenia s intenzitou 100W
  • konfokálny násadec so 4 lasermi, v jednom boxe, pre spresnenie práce so zariadením najlepšie bez potreby ďalšieho centrovania, v rozsahu: 405/488/561/640
  • konfokálny nástavec má možnosť dipozície skeneru so 4 PMT detektormi a má 32 kanálový PMT – spektrálny detektor pre zobrazovanie až 32 individuálnych spektrálnych kanálov 0 .6 s/úsek (512x512 pixelov , 4 obr./ sek. (256 x 256 piexlov , 1000 lps Veľkosť pixelu: max. 2048 x 2048 “One Shot” kvantitatívne 32 kanálové spektrálne zobrazenie s presnosťou a citlivosťou, rozsah spektra vlnových dĺžok 400-750 nm, rozlíšenie vlnových dĺžok 2.5nm (80nm), 6nm (192nm), 10nm (320nm) v krokoch 0.25 nm
  • 1x transmisný PMT s motorizovaným prepínaním
  • Štandardný  fluorescenčný detektor pre všeobecne používané filtre vlnová dĺžka: 400- 750nm (PMT), 400-720nm (GaAsP), 4 kanálový GaAsP multidetektor (2GaAsP&2PMT), odporúčané vlnové dĺžky: 450/50, 482/35, 515/30, 525/50, 540/30, 550/49, 585/65, 595/50, 700/75
  • analyzačnú stanica, ktorá umožňuje hore uvedené analýzy a zobrazovacie módy.
  • antivibračné vybavenie

 

Fluorescenčný mikroskop (zariadenie na detekciu a archivovanie  fluorescenčných signálov vzorky)

Princípom zariadenia je, že  využíva  žiarenie väčšej vlnovej dĺžky, ktoré niektoré látky po absorpcii UV žiarenia vysielajú (fluoreskujúca vlastnosť fluorescenčných farbičiek naviazaných na vzorkách.

 

1. Priamy: AxioImager M2, apotome 2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie má (obsahuje)

  • sadu fluorescenčných filtrov  FITC, DAPI, Cy3 HE, Cy5 a 20 HE
  • 2 kamerové systémy (6 Mpix chladená monochromatická digitálna kamera , 6 Mpix chladená farebná digitálna kamera)
  • 1 apochromatický objektív so zväčšením 40x, N.A 1.1, pracovná vzdialenosť  0.62 mm,  použiteľný na pozorovania v oblastiach spektra UV-VIS-IR
  • 1 apochromatický objektív so zväčšením 63x, N.A 1.15, pracovná vzdialenosť 0.60 mm, použiteľný na pozorovania v oblastiach spektra UV-VIS-IR
  • 1 apochromatický objektív so zväčšením 100x, N.A 1.25, pracovná vzdialenosť 0.25 mm, použiteľný na pozorovania v oblastiach spektra UV-VIS-IR
  • AxioVision software na analýzu zozbieraných dát

2. Invertovaný: Eclipse Ti-S,  Nikon kamera DSQi2

Zariadenie umožňuje  zachytávanie fluorescenčných signálov v živých alebo preparovaných celulárnych kultúrach priamo vo vzorkových nádobách pri vlnových dĺžkach 340-380 nm, 465-495 nm, 540/25 nm, ako aj uchovávanie a analýzu zozbieraných dát.

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie má (obsahuje)

  • okulár so zväčšním 10x
  • okulár CFI 10x / 22mm s dioptrickým vyrovnaním (+5 / -8 dioptrií)
  • objektívy: 4x, 10x, 20x, 40x, čo umožňuje zväčšenie v rozsahu 40-400x
  • monochromatická chladená kamera
  • excitačné a blokovacie filtre
  • pracovnú stanicu.

 

 

Svetelný mikroskop, (zariadenie na skríning celulárnych kultúr v svetlom poli)

Zariadenie na skríning celulárnych kultúr v svetlom poli a vo vyššom modulárnom kontraste priamo v rastových nádobách ako je Petriho miska.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje:

  • skríning vzoriek vo fázovom alebo vo vyššom modulárnom kontraste
  • akomodáciu až 6 objektívov
  • možnosť jemného a hrubého zaostrenia na oboch stranách tela zariadenia

Zariadenie má (obsahuje)

  • binokulárny tubus typu D /s nízkym náklonom), umožňuje pozorovanie konoskopických obrázkov pomocou Bertrandovej šošovky
  • štyri  objektívy 4, 10, 20 a 40x, pričom objektívy 10x, 20x, 40x sú použiteľné pre vyšší modulárny kontrast
  • systémový otočný kondenzor určený pre sledovanie vo svetlom poli a vo vyššom modulárnom kontraste

 

 

Zariadenia na prípravu vzorky

 

 

Ultramikrotóm Leica EM UC7 (príprava polohrubých a ultratenkých rezov z biologických vzoriek zaliatych v médiu)

 

Prístroj je plne automatizované zariadenie navrhnuté na prípravu tenkých až ultratenkých sekcií (0.2-15mm) z tkaniva zaliateho v epoxidovej živici (epon). Vzorka je narezávaná vysoko presnými diamantovými, sklenenými reznými nástrojmi a použitá pre následnú analýzu elektrónovou mikroskopiou.

Ultramikrotóm je zložený z mechanickej časti (držiak noža, držiak vzorky, okulár, ovládacie tlačidlá na nastavenie hrúbky rezov, intenzity svetla, posunu diamantového noža,  rýchlosť krájania) zabudovanej v masívnom stole. Súčasťou mikrotómu je aj kontrolná dotyková jednotka – obrazovka, pod ktorou na malom pracovnom pulte sú ďalšie otáčacie tlačidlá potrebné na zabezpečenie presného chodu prístroja.

 

 

Kryostat Leica CM1950 (príprava polohrubých a ultratenkých rezov zo zmrazených biologických vzoriek pri nízkych teplotách )

 

 

Prístroj je navrhnutý na rutinné rezanie mrazených tkanív zaliatych v špeciálnom médiu/vode  na ďalšie použitie mikroskopom. Možnosť rezov 1-600µm. Prístroj pracuje pomocou rýchleho mrazenia vzorky v prostredí s regulovanou teplotou od -10 ºC  do -50 ºC. Na dosiahnutie optimálneho výkonu sú polohovateľný stolík na vzorky a držiak noža umiestnené vo vnútri chladiacej komory. Hlavná časť kryostatu (rotačne výkyvný mikrotom) je namontovaná mimo komory, aby sa získalo viac priestoru na prácu v komore a ľahšie čistenie. Teplota a hrúbka rezov sa nastavujú pomocou ovládacieho panelu umiestneného nad pracovnou chladiacou komorou.

 

 

GentleMACSTM Octo Dissociator (zariadenie na disociáciu a homogenizáciu vzorky)

 

Zariadenie je určené na  mechanické spracovanie vzoriek - homogenizáciu a disociáciu čerstvých alebo mrazených vzoriek rôznych druhov živočíšnych aj ľudských tkanív. Celý proces prebieha pri teplotnej optimalizácii inkubácie v uzavretom systéme túb, čím je zabezpečená vysoká úroveň užívateľskej bezpečnosti a sterilná práca so vzorkami.

 

 

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje:

  • disociáciu a homogenizáciu vzoriek s možnosťou nastavovania rôznej intenzity spracovania – s nastavovaním rýchlosti a smeru homogenizácie: +20 to +4 000 ot/min v smere a -20 až -4 000 ot/min proti smeru hodinových ručičiek
  • aseptické spracovanie vzoriek, pridanie enzýmu alebo kokteilu enzýmov
  • spracovávať až 8 vzoriek v jednom chode
  • nezávislé spracovávanie jednotlivých vzoriek.

 

 

Lyofilizátor Scanvac Cool Safe 55-4 (Zariadenie na dehydratáciu vzorky)

Zariadenie je určené na dehydratáciu vzoriek s minimálnym rizikom ich oxidácie alebo nešpecifickej degradácie.

Základná jednotka obsahuje kompresor pre chladenie, riadiaci mikroprocesor, kondenzor a lyofilizačný bubon.

 

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie pre Biochemické a molekulárne analýzy

 

Mikrolitrový spektrofotometer NanoVue™ Plus Spectrophotometer (Zariadenie na kvantifikáciu nukleových kyselín a proteínových vzoriek)

 

Zaradenie poskytuje možnosť merania vzoriek v malom objeme, kde pomocou predprogramovaného širokého spektra metód s využitím UV alebo interkalačných farbičiek (pre metódy ako je Lowry, Bradford, BCA, Biuret) umožňuje skenovanie plnej vlnovej dĺžky. Vzorky je možné po nameraní opäť odpipetovať a použiť na ďalšie analýzy.

• Rozsah vlnových dĺžok 200-1100 nm

• Automatická alebo manuálna selekcia cesty lúča

• Počet možných uložených metód merania 90

• Spektrálna šírka 5 nm

• Presnosť snímania vlnovej dĺžky ± 2 nm

• Reprodukovateľnosť snímania vlnovej dĺžky ± 0.5 nm

• Presnosť absorbancie maximum ± 1% (pri259 nm) pri 0.7 do 0.8 A pri použití uracilu

• Zdroj svetla stabilizovaná xenónová lampa s dlhou životnosťou

• Možnosť práce so vzorkami v rozsahu objemov 0.5 – 5 µl.

 

 

Thermocycler: CFX96 Touch™ Real-Time PCR Detection System (Zariadenie pre kvantitatívnu amplifikáciu templátu v reálnom čase)

 

Zariadenie pre kvalitatívnu analýzu nukleových kyselín určené na pomnožovanie vybraných úsekov DNA s využitím metódy PCR a RT - PCR. Zariadenie je flexibilné, umožňujúce uskutočnenie širokej škály analýz, zabezpečuje vysokú účinnosť amplifikácie a spoľahlivé vyhodnotenie výsledkov analýz spolu s detekciou teploty topenia.

• Možnosť sledovania zmeny fluorescencie 6 farbičiek pomocou fotodiód v rozsahu emisných vlnových dĺžok 450 nm až 730 nm

• Možnosť nastavenia teploty v rozsahu 0 °C až 100 °C s možnosťou chladenia po skončení analýzy, s presnosťou aspoň ±0.2 °C

• Maximálna rýchlosť ohrevu a chladenia termobloku 3-5°C/s

• Zariadenie s teplotným gradientom

• Možnosť ovládania a nastavenia bez potreby pripojenia na počítač pomocou vstavaného displeja a klávesnice

• Dynamický rozsah 10 rádov

• Podporovaný objem v rozmedzí 5-50µl.

 

 

Ultracentrifúga Optima™ XPN -100 (Separácia jednotlivých elementov vo vzorke pri ultravysokých otáčkach)

 

Zariadenie   je univerzálna laboratórna chladená centrifúga  určená na separáciu jednotlivých elementov vo vzorke (v skúmavkách, fľašiach s objemov až do 250 ml celkovo) pri ultravysokých otáčkach.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje:

  • maximálne otáčky 100 000 otáčok/min s uhlovým rotorom, maximálnu odstredivú silu 802 400xg (rcf) s uhlovým rotorom a 485 000xg (rcf) s výkyvným rotorom
  • nastavenie teplôt 0°C až +40°C po 1°C
  • nastavenie času v rozmedzí od 1 min do 999:59 h
  • zaznamenať teplotu a otáčky v priebehu separácie
  • Uloženie 1000 užívateľských programov s 30 krokmi
  • 10/11 stupňov zrýchlenia/spomale
  • automatickú identifikáciu rotorov
  • detekciu imbalancie rotora
  • kalkuláciu a simuláciu separácii pomocou eXPert software

Doplnkom k  zariadeniu je  aj titánový uhlový rotor s kapacitou 6 x 94 ml, titánový rotor výkyvný 6 x 38.5 ml, titánový rotor uhlový 8 x 39 ml

 

 

Centrifugačný koncentrátor CentriVap (Zariadenie na zakoncentrovanie vzorky)

 

Zariadenie určené pre rýchle, šetrné a efektívne zahusťovania roztokov nukleových kyselín a proteínov s výsledkom zvýšenia ich koncentrácie.

  • kapacita rotora 60 vzoriek 1.5/2.0 ml alebo 72 vzoriek 0.5 ml
  • kompatibilita so skúmavkami 1.5/2.0 ml alebo 0.5 ml
  • možnosť dosiahnuť 1725 otáčok za minútu zaistený striedavým motorom
  • možnosť vákua o minimálnej hodnote 29.6““Hg a má čerpacie kapacity min. 34 l/min
  • možnosť ohrevu vzorkovej komory mikroprocesorom riadený 300W do 100 ° C v krokoch po jednom stupni

 

 

Multiphor II Electrophoresis System (Systém na charakterizáciu proteómov pri variabilných podmienkach)

 

Univerzálny systém pre horizontálnu elektroforézu, izoelektrické zaostrovanie, 2D elektroforézu a elektroforetický transfer.

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje

  • realizovanie 1D, 2D elektroforézy, DNA fragmentovej analýzy, izoelektrickú fokusáciu
  • natívne alebo denaturačné separácie
  • charakterizáciu zdrojových prvkov proteómov
  • alnalytické alebo tiež preparatívne separácie proteínov a peptidov
  • analýzu zozbieraných dát

 

 

Elektroforetické a blotovacie zariadenie Biorad Mini-PROTEAN (Zariadenie je určené na elektroforézu a tranfer proteínov z gélu na membránu)

Princípom elektroforézy je delenie proteínov v elektrickom poli podľa veľkosti náboja, molekulovej hmotnosti a tvaru. Ako nosič sa využíva polyakrylamidový gél. Prenos proteínov z gélu na membránu prebieha medzi plošnými elektródami s pruhmi papierov nasiaknutými blotovacím roztokom. Gél s rozdelenými proteínmi , alebo membrána môžu byť následne požité pre viaceré metódy (zymografia, western blot metóda..)

 

 

 

Zariadenie na výskum bunkových kultúr

 

 

CO2 inkubátor pre bunkové kultúry ESCO (Inkubačná stanica s kontrolovanou atmosférou)

 

Zariadenie je určené pre kontrolovaný rast organizmov vo vzorkových nádobách s možnosťou kontroly obsahu CO2 a teploty.

  • rozsah kontroly obsahu CO2 0-20%
  • rozsah kontroly vnútornej teploty +3°C nad teplotou okolia až 60°C
  • možnosť pripojenia O2, aj CO2 senzora
  • filtrovanie atmosféry ULPA
  • možnosť dekontaminácie zariadenia cyklom validovaným aj podľa HPA UK

 

 

Biohazard box Bio II Advance 4 (Pracovný box s filtrovanou atmosférou)

 

Zariadenie je pracovný box s filtrovanou atmosférou s účinnosťou 99.995% pre častice od 0,1 do 0,3 mikrónov

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje

  • prácu s biologicky nebezpečnými materiálmi triedy 2
  • prácu pod UV lampou

 

 

Cytometer Guava easyCyte 8HT (Zariadenie určené na charakterizáciu bunky na úrovni jednej častice )

Zariadenie je určené na charakterizáciu bunky na úrovni jednej častice, pri ktorej jednotlivé bunky s naviazanou monoklonálnou protilátkou značenou fluorochrómom prechádzajú analyzačnou komorou. Po interakcii s monochromatickým laserovým lúčom dochádza k lomu a odrazu svetla a tým sa získava fluorescenčný signál. Z jednej bunky sa dá získať naraz niekoľko fluorescenčných signálov. Takto sa analyzujú fyzikálne charakteristiky jednotlivých buniek - určuje sa ich veľkosť, štruktúra membránového povrchu a granulácie.

Prietoková cytometria je bioanalytická metóda spájajúca v sebe princípy fluorescenčnej mikroskopie a hematologického analyzátora.

Zariadenie umožňuje:

  • Možnosť simultánnej detekcie až 8 detekčných parametrov, pričom zariadenie má 6 detektorov pre fluorescenčné farbičky a dva detektory pre rozptýlené svetlo, čo umožňuje detekciu veľkosti a komplexnosti analyzovanej častice
  • detekciu fluorescencie v rozsahu 525-785nm, pričom umožňuje detekciu nasledovných farebných spektier: 525/30nm zelená, 583/26nm žltá, 690/50nm červená1, 785/70nm NIR1, 661/19 červená 2, 785/70nm NIR2 •
  • priame a absolútne počítanie buniek
  • Umožňuje automatizáciu procesu s použitím až 96 vzoriek v jednom chode a 10 skúmaviek

 

 

Zariadenia pre kvapalinovú chromatografiu a hmotnostnú spektrometriu


Chromatograf: Ultimate 3000 RSLC nano (Zariadenie nanoobjemovej chromatografie); Hmotnostný spektrometer: Amazon SL

 

Zariadenie nanoobjemovej chromatografie a hmotnostného spektrometra na princípe 3D iónovej pasce vrátane chromatografického systému pre nano a mikro prietoky umožňujúce  1D, 2D chromatografiu

 

 

Zariadenie umožňuje:

  • identifikáciu a charakterizáciu peptidov, proteínov, automatickú prácu s proteomickými databázami, identifikáciu lokalizáciu posttranslačných modifikácií, analýzu intaktných proteínov a denovo sekvenovania
  • predikciu, detekciu, identifikáciu metabolitov, produktov organických syntéz, alebo iných transformačných procesov na základe porovnávania chromatografických záznamov, MS a MS/MS spektier, biotransformačných pravidiel a chemickej štruktúry materskej látky
  • realizáciu profilovacej analýzy – diferenciálna analýza setov vzoriek s pomocou analýzy hlavných komponentov ako sú napríklad (PCA), PLS a T-test
  • prepojenie s hmotnostnou spektrometriou
  • bežné, kvantitatívne aj kvalitatívne spracovanie dát MS aj MS/MS
  • možnosť normalizovanej kolíznej energie
  • detekciu aj  trojnásobne nabitých iónov
  • Digitálna kontrola všetkých parametrov

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Zariadenie obsahuje:

  • programové vybavenie na identifikáciu a charakterizáciu proteínov, ako aj vybavenie pre profilovacie experimenty a metabolomické analýzy
  • modulárny systém s  dvomi pumpami pre nano mikro prietokovú chromatografiu s možnosťou využitia konfigurácie pre minimálne 1D a 2D nano chromatografiu
  • nanopumpu bez delenia mobilnej fázy s prietokom v rozsahu 0,05-50 µl/min, binárny gradient
  • pumpu pre 2D chromatografiu s prietokom v rozsahu 10 – 2500 μl/min, binárny gradient
  • autosampler s termostatom pre 100 vzoriek s kompatibilitou pre  2 ml skúmavky, 3x platničku 96 jamkovú a  3 x platničku 384 jamkovú, nastrekované objemy 20 nl-125 ul s rýchlosťou nástreku menšou ako 30 s pre 1 ul plný nástrek, rôzne nástrekové metódy ako je plná slučka, parciálna slučka, nízko-disperzná injekcia, termostatovanie vzoriek 4 – 45° C
  • kolónový termostat s automatizovanými termostatovanými prepínacími ventilmi
  • zásobník na rozpúšťadlá a odplyňovač mobilných fáz
  • UV detektor (typ DAD) s možnosťou detekcie 8 vlnových dĺžok a zároveň plných spektier, rozsah nastavenia vlnových dĺžok 200-800 nm s presnosťou aspoň ± 1nm, detektorová cela s objemom ideálne 2,5 µl
  • fluorescenčný detektor s možnosťou nastavenia 4 emisných a 4 excitačných vlnových dĺžok v minimálnom rozsahu 200-880 nm excitácia, 200-900 nm emisia, detektorová cela  2,5 µl
  • hmotnostný spektrometer v usporiadaní iónová pasca 3D – ultrarýchla vysokokapacitná iónová pasca pre ultrarýchle skenovanie s vysokou citlivosťou a maximálnym rozlíšením
  • generátor dusíka zodpovedajúci potrebám hmotnostného spektrometra, čistota generovaného dusíka 99.5%, minimálne 32l /min, menej ako 0.5% zbytkového dusíka, tlak výstupu 6.9 bar
  • robustný štvorstupňový systém čerpania vákua umožňujúci vysokú priechodnoť iónov
  • Iónový zdroj s rozsahom prietokov 1-1000 µl/min
  • Iónový zdroj nano s rozsahom prietokov 0,05 – 50 μl/min
  • Integrovaná lineárna dávkovacia pumpa
  • Integrovaný prepínací ventil  SRM monitoring, MRM monitoring
  • Auto MS/MS a Auto MSn ( n <= 5)
  • Msn pre štruktúrnu analýzu ( n <= 11)
  • „Neutral Loss“ sken
  • dátovo závislé skeny umožňujúce aktívnu exklúziu, pasívnu exklúziu, definovanie preferovaných iónov

 

 

Zariadenia pre fluorescenčnú spektroskopiu a luminiscenciu


Spektrofluorometer FluoroLog (Fotoluminscenčné detekčné zariadenie určené na detekciu fyzikálnych charakteristík a parametrov analyzovaných vzoriek)

Zachytáva emitované svetlo dvojicou monochromátorov a na základe excitácie dvomi vertikálnymi zdrojmi zachytáva a vyhodnocuje široké spektrum intenzity žiarenia pri vysokom rozlíšení a citlivosti. Zariadenie je určené najmä na analýzu nehomogénnych biologických vzoriek ako sú napr. lipidy a proteíny.

  • fokusácia na všetkých vlnových dĺžkach
  • excitácia – rozsah vlnových dĺžok: 200-950 nm optimalizovaná pri UV
  • emisia – rozsah vlnových dĺžok: 200-950 nm optimalizovaná pri viditeľnom svetle
  • emisný detektor na princípe fotonásobiča s minimálnym 200 – 850 nm
  • referenčný detektor na princípe fotodiód
  • modul na vzorky typu T-box,  umožňujúci sekundárnej detekcie emisného kanálu
  • možnosť stanovenia polčasu rozpadu aspoň 30 ps s TBX/PPD detektorom

 

 

Multidetekční reader Synergy H1  (Hybridný systém určený na detekciu a analýzu luminiscencie a fluorescencie

Systém určený na variabilné merania ako sú:

  • fluorescencenčná intenzita
  • “timeresolved“ fluorescencia
  • fluorescenčná polarizácia.
  • absorbancia
  • luminiscencia
  • filtrovaná luminiscencia,

Zariadenie obsahuje:

  • modul určený pre prácu v aeróbnom prípadne anaeróbnom prostredí – použitie na prácu s baktériami a kvasinkami
  • modul určený pre prácu so živočíšnymi modelmi v štandardnom prostredí
  • rozsah vlnových dĺžok pri detekcii fluorescencie 250-700  s plynulým nastavovaním v danom rozsahu po 1 nm s využitím monochromátorového systému
  • pri absorbancii, možnosť nastavenia vlnovej dĺžky v rozmedzí 230-999 s plynulým nastavením v celom rozsahu po 1 nm

 

 

Zobrazovacie systémy

 

Amersham Imager 600 (Zariadenie na zobrazovanie chemiluminiscenčných, fuorescenčních a kolorimetrických vzoriek)

 

Zariadenie je určené na identifikáciu a kvantifikáciu proteínov a DNA v géloch a na membránach.

 

 

 

 

Funkčná charakteristika prístroja:

  • Citlivá CCD kamera s 3,2 megapixely
  • Schopnosť rýchleho chladenia detektoru
  • Chemiluminiscenčné snímkovanie s vysokou citlivosťou

Zariadenie umožnuje:

  • Generovanie kombinovaného farebného zobrazenia chemiluminiscenčných vzoriek a zobrazenia farebného markeru v bielom svetle
  • Fluorescenčné snímkovanie s modrým, zeleným a červeným svetelným zdrojom Epi a UV   trans iluminátorom
  • Farebné snímky kolorimetricky farbených gélov alebo membrán pri osvetlení bielym svetlom
  • Presnú kvantifikácia farbených gélov
  • Analýzu získaných snímkov

 

 

Typhoon FLA 9500 (Laserový skener umožňujúci zobrazenie a kvantifikáciu proteínov, nukleových kyselín a iných biomolekúl)

 

Zariadenie je variabilný  laserový skener s modulárnym prístupom k optickým komponentom umožňujúcim zobrazovanie a kvantifikáciu proteínov, nukleových kyselín a iných biomolekúl.

 

 

 

 

 

Zariadenie umožňuje:

  • detekciu vo viacerých módoch ako je fluorescenčný, kolorimetrický, chemiluminiscenčný, digitalizačný mód
  • zobrazovanie a analýzu variabilných typov vzoriek na rôznych typoch nosičov a to gély, bloty, 2D DIGE gély, 2D gély, tkanivové sekcie, array-e, film
  • vysokosenzitívne rozlíšenie skenu s nastavením  10-1000 µm

Zariadenie obsahuje:

  • modrý laser 473 nm, zelený laser 532nm, červený laser 635 nm, po rozšírení aj 635 nm červený laser a 785 nm NIR laser.
  • dva detektory PMT, PMT , jeden optimalizovaný pre detekciu nízkofrekvenčných vlnových dĺžok, jeden pre oblasť vysokofrekvenčných vlnových dĺžok
  • blok s nízko fluorescenčného skla pre dosiahnutie vysokej senzitivity meraní

 

 

Zariadenia NA FYZIOLOGICKÉ experimenty

 

Pneumotachografický merací systém, Ad Instruments (Prístroj určený na zaznamenanie krvného tlaku a srdcovej frekvencie pre malé zvieratá)

 

Systém zabezpečujúci neinvazívne meranie krvného tlaku malých laboratórnych zvierat metódou chvostovej pletyzmografie.

 

 

 

 

 

Zariadnie obahuje:

  • Chvostovú manžetu a snímač pulzu
  • softvér pre kontinuálny záznam a analýzu dát LabChart

 

 

Langendorffova aparatúra (Systém je zariadenie určené pre „in vitro“ experimenty)

 

• Zariadenie na meranie zmien monofazického akčného potenciálu pomocou endo- a epikardiálných MAP katétrov (AD Instruments)

• Softer na zber a analýzu dát (PowerLab, AD Instruments)

 

Zariadenie obsahuje:

  • Langendorffov perfúzny aparát
  • Izolovaný elektrický stimulátor s minimálnymi parametrami 10/100V/50mA
  • Vodnú pumpu pre zabezpečenie cirkulácie média s minimálnym objemom 15 l
  • Jednokanálový prietokomer
  • Chirurgickú termo podložku s teplotným senzorom
  • Sadu stimulačných elektród a chirurgického náradia
  • Umelý ventilátor pľúc pre hlodavce
  • Trojzvodové EKG
  • Tlakové katetre pre malé hlodavce
  • Zdroj svetla so svetlovodmi
  • Zosilňovače, systém na zber dát

Kompletný systém na experimenty in vivo vrátane chirurgických zákrokov na koronárnych arteriách srdca

 

Zariadenie obsahuje

• Umelý ventilátor pľúc pre hlodavce

• Chirurgické termo podložky s teplotným senzorom

• Sadu stimulačných elektród a chirurgického náradia

• Trojzvodové EKG

• Tlakové katetre pre malé hlodavce – na invazívne meranie periférnej hemodynamiky

• Millarove intrakardiálne P-V katétre – na merania vnútrokomorového tlaku, objemu a ich vzťahov na určenie centrálnej hemodynamiky (Millar, USA)

• Zdroj svetla so svetlovodmi

• Zosilňovače, systém na zber a analýzu dát (PowerLab, AD Instruments)

 

 

Kardiovaskulární ultrazvukový systém Vivid E9 XDclear (Elektrokardiografické a ultrazvukové zariadenie pre malé zvieratá)

 

Elektrokardiografické a ultrazvukové zariadenie pri použití dostupných sond umožňuje:

  • 4D zobrazovanie srdca
  • periferálne vaskulárne zobrazovanie
  • abdominálne zobrazovanie
  • transkraniálne zobrazovanie
  • zobrazovanie malých orgánov
  • muskuloskeletárne zobrazovanie
  • vytvoriť záznam echokardiogramu a doppler pri malých zvieratách
  • spracovania dát po vyšetrení malých hlodavcov – Rodent modul

 

 

Hypoxická komora: COY model 30 (Hypoxická komora pre in vivo štúdie)

 

Popis:

Hypoxická komora určená  pre in vivo štúdie je kompaktné uzavreté zariadenie, ktoré umožňuje sledovanému živočíšnemu objektu žiť v definovanom čase v špeciálne navodených životných podmienkach napr. so zníženými alebo zvýšenej  hodnotami O2.

Zariadenie umožňuje:

  • možnosť zmeny hladiny O2
  • možnosť dodať N2, O2
  • možnosť kontroly CO2 a O2
  • možnosť cirkulácie atmosféry
  • možnosť prívodu média

 

 

· Analyzátor krvných plynov: ABL80 FLEX (Prístroj určený  na stanovenie základných parametrov krvných plynov a elektrolytov)

 

Prístroj určený  na stanovenie základných parametrov krvných plynov a elektrolytov vrátane stanovenia laktátu z veľmi malého objemu vzorky v krátkom čase. Každé stanovenie pribieha elektrochemicky na samostatnej elektróde za použitia roztokov s optimálnym pH prostredím.

 

 

 

 

 

 

 

 

Možnosť stanovenia:

  • pH v rozsahu 6-8
  • pCO2 mmHg v rozsahu 0-150 a kPa v rozsahu  0.0-20.0
  • pO2 v rozsahu  mmHg 0-760 a kPa v rozsahu  0.0-101.3
  • pCa2+ mmol/L v rozsahu 0.00-5.00/ mEq/L v rozsahu 0.00-10.00/ mg/dl v rozsahu 0.00-20.00
  • cCl- mmol/L v rozsahu 0-250/ mEq/L v rozsahu 0-250, cK+ mmol/L v rozsahu 0.0-20.0/ mEq/L 0.0-20.0
  • cNa+ mmol/L v rozsahu 0-210/ mEq/L 0-210
  • hematokritu Hct 0-85%
  • laktátu cLac

 

 

In-Vivo Imaging System FX Pro (Systém na sledovanie distribúcie a lokalizácie látok v  "in vivo" experimentoch určený pre malé pokusné zvieratá

 

Popis:

Tento systém kombináciou multispektrálnej fluorescencie, luminiscencie, digitálneho röntgenu a rádioizotopového zobrazovania poskytuje presnú lokalizáciu molekulárnych a bunkových biomarkerov v živých organizmoch.

Zariadenie umožňuje:

  • neinvazívne meranie biologických procesov v živých organizmoch
  • kvantitatívne zobrazovanie multispektrálnej fluorescencie, luminiscencie a rádioizotopom značených biomolekúl v kombinácii s X-ray zobrazovaním
  • chemiluminiscenčné snímkovanie s vysokou citlivosťou (western blot membrána)
  • Farebné snímky kolorimetricky farbených gélov alebo membrán pri osvetlení bielym svetlom

Zariadenie obsahuje:

  • Monochromatickú CCD kameru
  • megapixelové rozlíšenie 2048 x 2048px
  • Objektív 10x zoom, 20 - 200 mm, ƒ2.8
  • xenónový zdroj svetla
  • Epi – biely svetelný zdroj
  • Trans-biely svetelný zdroj
  • 15 excitačných filtrov a 4 emisné filtre
  • hliníkové filtre
  • softvérový algoritmus odstraňujúci autofluorescenciu
  • softvér identifikuje fluorochrómy

 

 

Systém na úpravu vody

 

Direct-Q5 (Systém na úpravu vody)

 

Prístroj je kompaktný plne automatický systém na výrobu vody typu III (voda čistá, po reverznej osmóze) a zároveň výrobu ultračistej vody typu I (ultra čistá laboratórna voda pre účely molekulárnej biológie, prácu s bunkovými kultúrami a pod.). Systém využíva ako zdroj vody priamo vodovodný zdroj. Zariadenie produkuje analyticky čistú vodu kontinuálne monitorovanú na obsah organických látok ožiarením UV lampou.

• Výkon systému 5 litrov/hodinu

• Systém obsahuje UV lampu (185/254nm)

• Systém obsahuje patrónu na prečistenie vstupnej vodovodnej vody, skladajúcu sa z častí reverznej osmózy a ionexu

• Systém obsahuje koncový filter slúžiaci na odstránenie nukleáz a pyrogénnych látok

• Systém obsahuje 30 litrový závesný zásobník s ovzdušňovacím filtrom

• Systém obsahuje sanitačný modul umožňujúci ožiarenie v zásobníku vo zvolených časových intervaloch v rámci 24 hodinového režimu pre minimalizovanie množenia baktérií v zásobníku

• Systém s integrovanou pumpou, min inlet P 1.0 bar